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华西协合大学药建于1918年,创始人是加拿大米玉士博士。办院之初就开始收集来自于世界各地的药用植物品种和标本。1958年,市政府开建人民南路,划拨了一些农田作为教学科研用地的补偿,其中10余亩用作药用植物园的建设。药用植物园,分为石生藻区、阴生区、温室等在内的31个繁殖区,种植中药、草药植物1000余种,不仅包括名贵中药材,还包括野生变家种和其他一些科研项目栽植品种。1983年在园内新建生药标本馆,设腊叶和生药两个陈列室。
如今,药用植物园占地 15亩,含有生药标本馆、腊叶标本室,现存药用植物标本4万余份,已鉴定标本约2万份,包括2600余种药用植物;生药标本室现存植物、动物、矿物等经常使用药材标本748种、1409份,包括冬虫夏草、川芎、川贝母、黄连等经常使用及川产地道药材标本。标本馆还珍藏有20世纪30年代德国E.Merck制作的全世界各地发生药标本329种、美国ILLY制作的生药标本216种。
华西药用植物园因其是中国高校建设最早、品种最多的天然植物药科学研究和人才培养基地而蜚声海内外。